Научно-исследовательская лаборатория молекулярной биологии и генетики



Заведующий лабораторией
Светлана Витальевна Боронникова
Д.б.н., профессор, Почетный работник 
высшего профессионального образования РФ
E-mail: Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.




 
История
 
Научно-исследовательская лаборатория основа в 2010 году в ходе реализации проекта  развития университета как национального исследовательского (ПГНИУ) в направлении развития геномных и биоинформационных технологий. Лаборатория сформировалась как центр инновационных молекулярно-генетических исследований растений; молекулярно-генетической идентификации и паспортизации популяций растений и животных. 
 
Средний возраст сотрудников: 30 лет. 

За время работы:
• защищены 4 кандидатские диссертации по сп «Генетика», у которых второй специальностью являлись «Ботаника» и «Экология»; 
• выполнены 6 НИР по генетике, 
• получен патент. 
 
На базе лаборатории проводятся занятия по дисциплинам генетического цикла профиля «Генетика», ООП «Генетика», «Микология», «Экосистемы лесов и рациональное лесопользование», выполняются выпускные квалификационные, дипломные работы, магистерские диссертации, а также кандидатские диссертации в рамках программы обучения в аспирантуре 03.02.07 «Генетика». 
 
• Боронникова Светлана Витальевна – ведущий научный сотрудник, д.б.н. по сп. «Генетика», профессор, зав. лабораторией;
• Бельтюкова Надежда Николаевна – научный сотрудник, к.б.н. по сп. «Ботаника» и «Генетика»;
• Лисина Татьяна Николаевна –научный сотрудник, к.б.н. по сп. «Генетика»;
Бобошина Ирина Викторовна – младший научный сотрудник, к.б.н. по сп. «Генетика»;
• Нечаева Юлия Сергеевна – младший научный сотрудник, аспирант биологического ф-та;

 
• Комарова Лидия Васильевна – младший научный сотрудник, аспирант биологического ф-та;
• Пришнивская Яна Викторовна – инженер-исследователь, магистрант биологического ф-та.

 
Все научные работники являются сотрудниками или аспирантами кафедры ботаники и генетики растений биологического факультета.

 
Направления научных исследований
 
• Молекулярно-генетический анализ популяций редких травянистых и ресурсных древесных видов растений;
• ДНК-маркирование основных лесообразующих пород деревьев; 
• геномные, постгеномные и биоинформационные технологии;
• популяционная и экологическая генетика;
• структурная и функциональная геномика;
• выявление особенностей и оценка состояния генофондов редких и ресурсных видов растений на популяционном уровне;
• детекция нуклеотидных полиморфизмов в генах  биосинтеза лигнина,  устойчивости к холоду древесных видов растений;
• молекулярно-генетическая идентификация, штрихкодирование и оценка состояния  популяций  дикорастущих травянистых и древесных растений, сортов культурных растений; 
• IRAP(Inter-Retrotransposon Amplified Polymorphism )-метод анализа полиморфизма ДНК; клонирование и определение нуклеотидных последовательностей мобильных генетических элементов;
• генетический контроль легальности заготовки древесины;
• молекулярно-генетический анализ физических качеств человека, включая анализ генетической предрасположенности к занятиям определенными видами спорта  (каратэ и самбо);
• генетика человека;
• молекулярно-генетический анализ популяций рыб.

 
Фундаментальные работы
 
Гранты и проекты с 2010 года:
• НИР «Новые технологии оценки генетического разнообразия как основы биологического разнообразия популяционных систем ресурсных растений при естественных колебаниях и антропогенной трансформации среды» (2010-2011, рук. Боронникова С.В.)
• «Анализ высокопродуктивных популяций хвойных видов растений Пермского края на основе результатов молекулярного маркирования их геномов» (2011, рук. Бельтюкова Н.Н.)
• Оценка состояния генофондов и популяционных систем ресурсных видов растений при естественных колебаниях и антропогенной трансформации среды с использованием новых геномных и биоинформационных технологий (2012-2013, рук. Боронникова С.В.)
•  Молекулярно-генетический анализ и оценка состояния популяционных систем ресурсных видов растений в связи с задачами их сохранения и рационального использования» (2014-2016 , рук. Боронникова С.В.)
•  У.М.Н.И.К. «Разработка технологии улучшения качества древесины лиственницы на основе ДНК-маркирования» (2013-2014, Нечаева Ю.С.)
•  ФЦП «Создание биосенсора для детекции и мониторинга стойких органических загрязнителей (полихлорированных бифенилов) в компонентах окружающей среды с использованием бактериальных клеток и микрожидкостного чипа» (2014-2015, рук. Плотникова Е.Г.)

 
Прикладные работы
 
• Три хоздоговорные работы «Молекулярно-генетический анализ и идентификация стад рыбоводных хозяйств и естественных популяций стерляди (Acipenser ruthenus  Linnaeus) Пермского края и прилегающих территорий» (2013-2014);
• 10 актов внедрения результатов исследований.

 
Сотрудничество (предприятия, вузы, научные учреждения)

• Федеральный научно-образовательный центр лесов, опасных природных явлений и ландшафта (Вена, Австрия, Federal Research  and  Training Centre for Forests, Natural Hazards and Landscape (BFW), Vienna, Austria,  Berthold Heinze);
• Институт национальных агрономических исследований (Париж, Эври  вал де Эссон, Франция, Institut National de la Recherche Agronomique Centre National de la Recherche Scientifique) Patricia Faivre Rampant)
• ФГБОУ ВПО «Башкирский государственный аграрный университет» (г. Уфа, Россия);
• Пермское отделение ФГБНУ ГосНИОРХ (г. Пермь, Россия).  
• Цикл лекций в 2013 и в 2014 гг, стажировка по биоинформатике с сентября по декабрь 2014 года на кафедре ботаники и генетики растений ПГНИУ и в лаборатории проф. университета г. Сковде (Швеция) Ульссона Б (Olsson B.).

 
Основные публикации

Монографии 
1. Боронникова С.В. Молекулярно-генетическая идентификация и паспортизация редких и находящихся под угрозой уничтожения видов растений. Перм. ун-т. Пермь, 2008. 120 с.
2. Боронникова С.В. Молекулярно-генетический анализ и  оценка состояния генофондов ресурсных видов растений Пермского края: монография. Перм. гос. нац. исслед. ун-т. Пермь, 2013. 223 с.:
 
Публикации в журналах, цитируемых в Scopus и Web of Science
1. Boronnikova S.V., Kalendar R.N. Using IRAP-markers for Analysis of Genetic Variability in Populations of Resource and Rare Species of Plants // Russian Journal of Genetics. 2010. Vol. 46, №1. P. 36–42.
2. Boronnikova S.V.  Genetic Variation in Ural Populations of the Rare Plant Species Adenophora lilifolia (L.) DC. inferred from ISSR-markers //  Russian Journal of Genetics. 2009. Vol. 45, №5. P. 573–576.
3. Svetlakova T.N., Boboshina I.V., Boronnikova S.V., Nechaeva Yu.S. An ecological and genetic analysis of population structure Populus tremula L. in Perm region // Russian Journal of Genetics: applied researches. 2013.  Vol. 3, № 5.  Р. 382–387.
4. Svetlakova T.N., Boronnikova S.V., Yanbaev Yu.A. Genetic diversity and differentiation in Ural populations of the aspen, Populus tremula L., as revealed by inter-simply sequence repeat (ISSR) markers // Silvae Genetica. 2014. V. 63.  № 1-2. P. 39-41.
 
Статьи в научных журналах, рекомендованных ВАК РФ 
2. Боронникова С.В., Календарь Р.Н. Использование IRAP-метода для анализа генетической изменчивости популяций ресурсных и редких видов растений // Генетика. 2010. Т. 46, №1. С. 44–50.
3. Боронникова С.В., Тихомирова Н.Н., Кравченко О.А. Анализ внутри и межпопуляционного генетического разнообразия редкого лекарственного вида Adonis vernalis L. с использованием IRAP-маркеров // Сельскохозяйственная биология. 2010. №1. С. 22–26.
4. Боронникова С.В., Мандрица С.А., Светлакова Т.Н. Генетическая и морфологическая изменчивость растений в условиях нефтяного загрязнения почв // Экологическая генетика. 2010. Т.8, №1. С. 59–63.
5. Светлакова Т.Н., Мандрица С.А., Боронникова С.В. и др. Оценка изменчивости морфологических признаков Trifolium pratenze L. в условиях нефтяного загрязнения почв // Вопросы современной науки и практики. Университет им. В.И. Вернадского. 2010. №1-3 (28). С.16–22.
6. Боронникова С.В., Тихомирова Н.Н., Смирнова А.В. Генетико-популяционные исследования Adonis sibirica Patrin ex Ledeb. (Ranunculaceae) c помощью IRAP-маркеров // Ботанический журнал. 2010. Т. 95, № 8. С. 1107–1115.
7. Боронникова С.В., Кокаева З.Г., Тихомирова Н.Н., Смирнова А.В., Бойкова А.А. Молекулярно-генетический анализ популяций Adonis sibirica Patrin ex Ledeb. на основании полиморфизма ISSR-маркеров // Успехи современной биологии. 2010.Т.130, №5. С.481–486.
8. Шестакова Е.А., Назаров А.В., Ананьина Л.Н., Боронникова С.В. Влияние клевера и овсяницы на очистку почвы, загрязненной углеводородами // Вестник уральской медицинской академической науки. 2011. № 4/1. С. 185–186.
9. Янбаев Ю.А., Габитова А.А., Боронникова С.В. Экологическая обусловленность межпопуляционной генетической дифференциации дуба черешчатого на Южном Урале // Вестник БГАУ. 2012. № 2. С. 63–65.
10. Светлакова Т.Н., Бобошина И.В., Нечаева Ю.С., Боронникова С.В. Генетическая дифференциация популяций Populus tremula L. в Пермском крае на основании полиморфизма ISSR-маркеров // Аграрный Вестник Урала. 2012. №3 (95). С.11–13.
11. Бобошина И.В., Боронникова С.В. Изучение генетического полиморфизма некоторых сортов Triticum aestivum L. с использованием ISSR-маркеров // Аграрный вестник Урала. 2012. № 5 (97). С. 19–20. 
12. Светлакова Т.Н., Боронникова С.В, Бобошина И.В. Детекция однонуклеотидных замен в генах Populus tremula L. // В мире научных открытий. 2012. Вып. 2. С. 20–24.
13. Королева Ю.А., Смолин А.М., Бобошина И.В., Светлакова Т.Н., Боронникова С.В. Микроклональное размножение видов рода Populus // Вестник Удмуртского университета. 2012. Вып.3. С. 50–54. 
14. Светлакова Т.Н., Бобошина И.В., Боронникова С.В., Нечаева Ю.С. Эколого-генетический анализ популяционной структуры Populus tremula L. в Пермском крае // Экологическая генетика. 2012. Вып.3. С. 43–47. 
15. Светлакова Т.Н., Боронникова С.В. Бобошина И.В. Детекция однонуклеотидных замен (SNP) в геноме Populus tremula L. в Пермском крае // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю.А. Овчинникова. 2012. Т.8. №2. С. 42–46. 
16. Бобошина И.В., Боронникова С.В. Идентификация перспективных для Урала сортов пшеницы мягкой с использованием межмикросателлитного анализа полиморфизма ДНК // Фундаментальные исследования. 2013. № 6,Ч.1. С. 92–97.
17. Янбаев Ю.А., Боронникова С.В., Светлакова Т.Н., Кочева Л.С., Карманов А.П., Загирова С.В. Популяционно-генетический анализ осины как основа отбора растительного материала с целью плантационного выращивания для целлюлозно-бумажной промышленности // Вестник БГАУ. 2013. №2. С. 62–64. 
18. Бобошина И.В., Боронникова С.В. Аллельные варианты Waxy-генов сортов пшеницы мягкой, возделываемых в Пермском крае и в Республике Башкортостан // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2013. Т. 17, № 3. С. 535–540. 
19. Нечаева Ю.С., Боронникова С.В., Юсупов Р.Р., Хайнце Б. Изучение полиморфизма ISSR-маркеров в природных искусственных популяциях лиственницы // Фундаментальные исследования. 2013. № 6, Ч. 6. C. 1426-1431.
20. Нечаева Ю.С., Боронникова С.В., Видякин А.И., Пришнивская Я.В., Юсупов Р.Р. Молекулярно-генетический анализ популяций хвойных видов растений на Урале и востоке европейской части России для сохранения и возобновления лесных ресурсов // Известия Самарского научного центра Российской академии наук. 2014. Т. 16. №1(3). С. 878-882.
21. Янбаев Ю.А., Боронникова С.В., Ахметов А.Р., Нечаева Ю.C., Пришнивская Я.В. Информативность ISSR-маркеров для выявления генетического разнообразия клена остролистного на Южном Урале // Вестник Оренбургского государственного университета. 2014. №6 (167). C. 94- 97.

Поделиться информацией: