Научно-исследовательская лаборатория молекулярной биологии и генетики



Заведующий лабораторией
доктор биологических наук, профессор,
Почетный работник высшего профессионального образования РФ
Светлана Витальевна Боронникова
(342) 2-396-229
Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.


История
Научно-исследовательская лаборатория основа в 2010 году в ходе реализации проекта  развития университета как национального исследовательского (ПГНИУ) в направлении развития геномных и биоинформационных технологий. Лаборатория сформировалась как центр инновационных молекулярно-генетических исследований растений; молекулярно-генетической идентификации и паспортизации популяций растений и животных.

Лаборатория проводит научные исследования в рамках целевой программы «Развитие научного потенциала высшей школы» по оценке генетического разнообразия популяционных систем ресурсных растений при естественных колебаниях и антропогенной трансформации среды.

На базе лаборатории проводятся занятия по дисциплинам генетического цикла профиля «Генетика», ООП «Генетика», «Микология», «Экосистемы лесов и рациональное лесопользование», выполняются выпускные квалификационные, дипломные работы, магистерские диссертации, а также кандидатские диссертации в рамках программы обучения в аспирантуре 03.02.07 «Генетика». 

Научные сотрудники:
Яна Викторовна Пришнивская – инженер-исследователь;
Лидия Васильевна Комарова – ассистент кафедры ботаники и генетики растений;
Юлия Сергеевна Васильева – доцент кафедры ботаники и генетики растений.
 
Направления научных исследований

• Молекулярно-генетический анализ популяций редких травянистых и ресурсных древесных видов растений;
• ДНК-маркирование основных лесообразующих пород деревьев; 
• геномные, постгеномные и биоинформационные технологии;
• популяционная и экологическая генетика;
• структурная и функциональная геномика;
• выявление особенностей и оценка состояния генофондов редких и ресурсных видов растений на популяционном уровне;
• детекция нуклеотидных полиморфизмов в генах  биосинтеза лигнина,  устойчивости к холоду древесных видов растений;
• молекулярно-генетическая идентификация, штрихкодирование и оценка состояния  популяций  дикорастущих травянистых и древесных растений, сортов культурных растений; 
• IRAP(Inter-Retrotransposon Amplified Polymorphism )-метод анализа полиморфизма ДНК; клонирование и определение нуклеотидных последовательностей мобильных генетических элементов;
• генетический контроль легальности заготовки древесины;
• молекулярно-генетический анализ физических качеств человека, включая анализ генетической предрасположенности к занятиям определенными видами спорта  (каратэ и самбо);
• генетика человека;
• молекулярно-генетический анализ популяций рыб.

Фундаментальные работы
• Молекулярно-генетический анализ и оценка состояния популяционных систем ресурсных видов растений в связи с задачами их сохранения и рационального использования» (2014-2016 , рук. Боронникова С.В.)
• У.М.Н.И.К. «Разработка технологии улучшения качества древесины лиственницы на основе ДНК-маркирования» (2013-2014, Нечаева Ю.С.)
• ФЦП «Создание биосенсора для детекции и мониторинга стойких органических загрязнителей (полихлорированных бифенилов) в компонентах окружающей среды с использованием бактериальных клеток и микрожидкостного чипа» (2014-2015, рук. Плотникова Е.Г.)
• У.М.Н.И.К. «Разработка тест-системы молекулярно-генетической идентификации стерляди (Acipenser ruthenus) как биотехнологический подход выявления высокопродуктивных форм, гибридов, видовой идентификации рыб и товарной продукции»
• РФФИ №18-34-00348\18. «Генетические ресурсы и оценка состояния генофонда западной расы лиственницы сибирской Larix sibirica Ledeb. (L. sukaczewii) Урала на основе полиморфизма микросателлитных маркеров» 2018-2019 гг.
• Грант, полученный по результатам конкурса иностранных фондов № 34/2018 «Молекулярно-генетический анализ генофондов популяций редких видов растений Северного Казахстана» 2018-2019 гг.

Прикладные работы
• Хоздоговорные работы «Молекулярно-генетический анализ и идентификация стад рыбоводных хозяйств и естественных популяций стерляди (Acipenser ruthenus  Linnaeus) Пермского края и прилегающих территорий» (2013-2014);
• Патент на изобретение №2505956 «Способ молекулярно-генетической идентификации популяций древесных видов растений» от 11 мая 2012 года;
• 10 актов внедрения результатов исследований.

Сотрудничество
• Федеральный научно-образовательный центр лесов, опасных природных явлений и ландшафта (Вена, Австрия, Federal Research  and  Training Centre for Forests, Natural Hazards and Landscape (BFW), Vienna, Austria,  Berthold Heinze);
• Институт национальных агрономических исследований (Париж, Эври  вал де Эссон, Франция, Institut National de la Recherche Agronomique Centre National de la Recherche Scientifique) Patricia Faivre Rampant)
• ФГБОУ ВПО «Башкирский государственный аграрный университет» (г. Уфа, Россия);
• Пермское отделение ФГБНУ ГосНИОРХ (г. Пермь, Россия).  
• Цикл лекций в 2013 и в 2014 гг, стажировка по биоинформатике с сентября по декабрь 2014 года на кафедре ботаники и генетики растений ПГНИУ и в лаборатории проф. университета г. Сковде (Швеция) Ульссона Б (Olsson B.).

Основные публикации

Монографии
1. Боронникова С.В. Молекулярно-генетическая идентификация и паспортизация редких и находящихся под угрозой уничтожения видов растений. Перм. ун-т. Пермь, 2008. 120 с.
2. Боронникова С.В. Молекулярно-генетический анализ и  оценка состояния генофондов ресурсных видов растений Пермского края: монография. Перм. гос. нац. исслед. ун-т. Пермь, 2013. 223 с.:
 
Публикации в журналах, цитируемых в Scopus и Web of Science
1. Boronnikova S.V., Kalendar R.N. Using IRAP-markers for Analysis of Genetic Variability in Populations of Resource and Rare Species of Plants // Russian Journal of Genetics. 2010. Vol. 46, №1. P. 36–42.
3. Svetlakova T.N., Boboshina I.V., Boronnikova S.V., Nechaeva Yu.S. An ecological and genetic analysis of population structure Populus tremula L. in Perm region // Russian Journal of Genetics: applied researches. 2013.  Vol. 3, № 5.  Р. 382–387.
4. Svetlakova T.N., Boronnikova S.V., Yanbaev Yu.A. Genetic diversity and differentiation in Ural populations of the aspen, Populus tremula L., as revealed by inter-simply sequence repeat (ISSR) markers // Silvae Genetica. 2014. V. 63.  № 1-2. P. 39-41.
5. Yu.S. Nechaeva, A.A. Zhulanov, S.V. Boronnikova, Ya.V. Prishnivskaya Nucleotide polymorphisms of candidate genes of adaptive significance in the Ural populations of Larix sibirica Ledeb Russian Journal of Genetics, 2017, V. 53, № 5, 9 p.

Статьи в научных журналах ВАК РФ
1. Боронникова С.В., Тихомирова Н.Н., Смирнова А.В. Генетико-популяционные исследования Adonis sibirica Patrin ex Ledeb. (Ranunculaceae) c помощью IRAP-маркеров // Ботанический журнал. 2010. Т. 95, № 8. С. 1107–1115.
2. Боронникова С.В., Кокаева З.Г., Тихомирова Н.Н., Смирнова А.В., Бойкова А.А. Молекулярно-генетический анализ популяций Adonis sibirica Patrin ex Ledeb. на основании полиморфизма ISSR-маркеров // Успехи современной биологии. 2010.Т.130, №5. С.481–486.
3. Шестакова Е.А., Назаров А.В., Ананьина Л.Н., Боронникова С.В. Влияние клевера и овсяницы на очистку почвы, загрязненной углеводородами // Вестник уральской медицинской академической науки. 2011. № 4/1. С. 185–186.
4. Янбаев Ю.А., Габитова А.А., Боронникова С.В. Экологическая обусловленность межпопуляционной генетической дифференциации дуба черешчатого на Южном Урале // Вестник БГАУ. 2012. № 2. С. 63–65.
5. Светлакова Т.Н., Бобошина И.В., Нечаева Ю.С., Боронникова С.В. Генетическая дифференциация популяций Populus tremula L. в Пермском крае на основании полиморфизма ISSR-маркеров // Аграрный Вестник Урала. 2012. №3 (95). С.11–13.
6. Бобошина И.В., Боронникова С.В. Изучение генетического полиморфизма некоторых сортов Triticum aestivum L. с использованием ISSR-маркеров // Аграрный вестник Урала. 2012. № 5 (97). С. 19–20.
7. Светлакова Т.Н., Боронникова С.В, Бобошина И.В. Детекция однонуклеотидных замен в генах Populus tremula L. // В мире научных открытий. 2012. Вып. 2. С. 20–24.
8. Королева Ю.А., Смолин А.М., Бобошина И.В., Светлакова Т.Н., Боронникова С.В. Микроклональное размножение видов рода Populus // Вестник Удмуртского университета. 2012. Вып.3. С. 50–54.
9. Светлакова Т.Н., Бобошина И.В., Боронникова С.В., Нечаева Ю.С. Эколого-генетический анализ популяционной структуры Populus tremula L. в Пермском крае // Экологическая генетика. 2012. Вып.3. С. 43–47.
10. Светлакова Т.Н., Боронникова С.В. Бобошина И.В. Детекция однонуклеотидных замен (SNP) в геноме Populus tremula L. в Пермском крае // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю.А. Овчинникова. 2012. Т.8. №2. С. 42–46.
11. Бобошина И.В., Боронникова С.В. Идентификация перспективных для Урала сортов пшеницы мягкой с использованием межмикросателлитного анализа полиморфизма ДНК // Фундаментальные исследования. 2013. № 6,Ч.1. С. 92–97.
12. Янбаев Ю.А., Боронникова С.В., Светлакова Т.Н., Кочева Л.С., Карманов А.П., Загирова С.В. Популяционно-генетический анализ осины как основа отбора растительного материала с целью плантационного выращивания для целлюлозно-бумажной промышленности // Вестник БГАУ. 2013. №2. С. 62–64.
13. Бобошина И.В., Боронникова С.В. Аллельные варианты Waxy-генов сортов пшеницы мягкой, возделываемых в Пермском крае и в Республике Башкортостан // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2013. Т. 17, № 3. С. 535–540.
14. Нечаева Ю.С., Боронникова С.В., Юсупов Р.Р., Хайнце Б. Изучение полиморфизма ISSR-маркеров в природных искусственных популяциях лиственницы // Фундаментальные исследования. 2013. № 6, Ч. 6. C. 1426-1431.
15. Нечаева Ю.С., Боронникова С.В., Видякин А.И., Пришнивская Я.В., Юсупов Р.Р. Молекулярно-генетический анализ популяций хвойных видов растений на Урале и востоке европейской части России для сохранения и возобновления лесных ресурсов // Известия Самарского научного центра Российской академии наук. 2014. Т. 16. №1(3). С. 878-882.
16. Янбаев Ю.А., Боронникова С.В., Ахметов А.Р., Нечаева Ю.C., Пришнивская Я.В. Информативность ISSR-маркеров для выявления генетического разнообразия клена остролистного на Южном Урале // Вестник Оренбургского государственного университета. 2014. №6 (167). C. 94- 97.
17. Нечаева Ю.С., Жуланов А.А., Красильников В.П., Боронникова С.В. Оценка состояния генофондов популяций западной расы лиственницы сибирской Larix sibiricaLedeb (L. sukaczewii) на северном и среднем Урале Современные проблемы науки и образования. 2016. № 3; URL: http://www.science-education.ru/article/view?id=24520
18. Пришнивская Я.В., Нечаева Ю.С., Красильников В.П., Боронникова С.В. Молекулярно-генетический анализ четырех популяций Pinus sylvestris L. на востоке Русской равнины на основании полиморфизма ISSR-маркеров Вестник Оренбургского государственного университета. 2016. №2(190). С. 88-93.
19. Боронникова С.В., Мартыненко Н.А., Нечаева Ю.С., Никоношина Н.А., Пришнивская Я.В. Молекулярно-генетический анализ популяций PopulusnigraL. на среднем и южном Урале на основании полиморфизма ISSR-маркеров Современные проблемы науки и образования. 2016. № 3; URL: https://science-education.ru/pdf/2016/3/24737.pdf
20. Пришнивская Я.В., Красильников В.П., Боронникова С.В. Молекулярно-генетическая идентификация популяций Pinus sylvestris L. на востоке русской равнины на основании полиморфизма ISSR-маркеров Вестник Пермского университета. Серия биология. 2016. №2. С. 171–176.
21. Мартыненко Н.А., Боронникова С.В. Водоросли порядка Desmidialesводоемов Пермского края Современные проблемы науки и образования. 2016. № 3; URL: https://science-education.ru/pdf/2016/3/24792.pdf
22. Боронникова С.В., Васильева Ю.С., Жуланов А.А., Пришнивская Я.В. Нуклеотидный полиморфизм адаптивно значимых генов-кандидатов в популяциях Larix sibirica Ledeb. Урала. Генетика, Москва, 2017, Т. 53, № 5, 9 с.

ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014–2020 годы»
Проект «Создание биосенсора для детекции и мониторинга стойких органических загрязнителей (полихлорированных бифенилов) в компонентах окружающей среды с использованием бактериальных клеток и микрожидкостного чипа»

Поделиться информацией: